Le Journal Officiel de ce dimanche 11 janvier 2026 vient de publier un arrêté qui redessine les contours des études pharmaceutiques, en particulier pour le troisième cycle court (6ème année). Que vous soyez titulaire d’officine, pharmacien adjoint ou étudiant, cette réforme, applicable dès la rentrée universitaire 2026, modifie profondément l’organisation des stages et l’obtention de l’agrément de maître de stage. Voici ce qu’il faut retenir de ce nouveau texte.
Cet arrêté est pris en application d’un décret du 29 décembre 2025, qui a introduit dans le code de l’éducation des dispositions réglementant le troisième cycle court des études pharmaceutiques, accessible aux étudiants et élèves pharmaciens des armées ayant obtenu la validation du deuxième cycle. Il fixe la durée de celui-ci à un an (deux semestres) et renvoie à un arrêté la définition du régime des études conduisant à l’obtention de ce DES. C’est cet arrêté qui vient de paraître et qui contient notamment les dispositions suivantes :
1. Un troisième cycle court « officine » plus structuré
Le diplôme d’études spécialisées (DES) de pharmacie officinale s’organise désormais sur deux semestres distincts, chacun comportant un stage de six mois :
- Premier semestre : Un stage d’approfondissement en pratique officinale.
- Second semestre : Un stage de pratique officinale en autonomie supervisée.
L’innovation majeure : L’un de ces deux stages doit être effectué en priorité dans une zone caractérisée par une offre de soins insuffisante (déserts médicaux). Cette mesure vise à favoriser l’installation des jeunes pharmaciens dans les territoires en tension.
Volume horaire et pédagogie
La formation inclut entre 200 et 350 heures d’enseignements à l’université. Le texte précise que ces cours doivent intégrer :
- La simulation et les technologies du numérique.
- La participation de patients, qui pourront désormais intervenir en binôme avec les enseignants pour partager leur expérience.
- La prescription et l’administration des vaccins.
2. Maîtres de stage : de nouvelles règles pour l’agrément
L’arrêté durcit et clarifie les conditions pour devenir maître de stage (MS). Désormais, l’agrément est délivré par le Directeur Général de l’ARS après avis d’une nouvelle instance : la Commission Pharmaceutique Officinale.
Les critères pour être Maître de Stage :
- Expérience : Justifier de 3 ans d’exercice officinal.
- Engagement : Signer une charte d’engagement (élaborée par l’Université et l’Ordre).
- Durée : L’agrément est valable 5 ans.
- Visite de contrôle : Des « conseillers de stage » (enseignants ou maîtres de stage expérimentés) réaliseront des visites au sein de l’officine pour évaluer la qualité du terrain de stage.
Note importante : Les titulaires, mais aussi les pharmaciens gérants (mutualistes/minières) et les pharmaciens adjoints (par délégation), peuvent désormais être agréés comme maîtres de stage.
3. Santé numérique et nouveaux soins
Le référentiel de compétences est mis à jour pour coller aux réalités de 2026. Deux nouveaux piliers font leur apparition :
- La Santé Numérique : Les étudiants doivent impérativement intégrer les outils numériques (télésanté, traitement des données de santé, systèmes d’information) dans leur pratique quotidienne.
- Gestes et Soins : La formation ne se limite plus aux « gestes », mais englobe explicitement les « soins », renforçant le rôle clinique du pharmacien.
4. La Thèse : un calendrier resserré
La soutenance de la thèse pour l’obtention du diplôme d’État de docteur en pharmacie doit désormais avoir lieu :
- Pendant le troisième cycle court.
- Ou, au plus tard, dans l’année universitaire suivant la fin du cycle.
Un délai supplémentaire d’un an peut être accordé par le président de l’université sur demande motivée. Le jury doit comporter au moins deux pharmaciens, et la présence d’un maître de stage ou d’un professionnel de santé est vivement souhaitée.
5. Flexibilité et réorientation
L’arrêté introduit un droit à l’erreur ou au changement de vocation. Un étudiant peut, à l’issue du 2ème cycle ou même pendant le 3ème cycle, changer d’orientation professionnelle (passer de l’officine à l’industrie, ou inversement). Cela nécessite :
- La validation des compétences spécifiques à la nouvelle voie (via un contrat pédagogique).
- L’accord du directeur de l’UFR et des coordonnateurs de DES.
Récapitulatif des changements clés
| Thématique | Avant 2026 | Dès la rentrée 2026 |
| Structure du stage | 6 mois continus souvent | 2 x 6 mois (Approfondissement + Autonomie) |
| Lieu du stage | Libre choix | Priorité aux zones sous-dotées (déserts médicaux) |
| Maîtres de stage | Agrément souvent tacite | Agrément ARS pour 5 ans + visite de l’officine |
| Adjoints | Moins impliqués officiellement | Peuvent être officiellement maîtres de stage |
| Contenu | Pharmacologie classique | Focus santé numérique et participation des patients |
